Sonic está de volta, e desta vez, ele precisa da ajuda de todos os seus amigos para derrotar o mal Dr. Eggman. Em Sonic Advance 3, Sonic e Tails deve se reunir com seus amigos Cream, Knuckles, Amy e. Equipe-se com qualquer um dos cinco personagens para ganhar movimentos de ataque especiais: Sonic aumenta sua velocidade, Tails aumenta o seu poder de salto, Knuckles aumenta seu poder de ataque, Amy oferece a Piko Piko martelo ataque, e creme permite que você execute um ataque homing. Com uma ligação Game Boy Advance, você e três de seus amigos podem se enfrentar em modos multiplayer.