Quando a Grande Guerra tomou conta do mundo, trazendo a civilização como a conhecemos, ao fim, que marcou o início de uma nova era de feitiçaria e magia. Os magos usado sua magia para manter a ordem, a paz reinou durante cem anos ... Até que um mago do mal chamado Draygon, visando controlar e dominar os seus semelhantes, começou a usar seus poderes de destruição e de conquista. Para combater o mal de Draygon, os outros mágicos construídos quatro espadas poderosas do vento, fogo, água e trovão. Usados ​​em conjunto, as espadas se transformar na mais poderosa arma já criada: a espada Crystalis. Mas Draygon apreenderam as armas e os espalhou muito grande e por toda a terra. Apenas uma esperança permaneceu: Um jovem rapaz, ele próprio um grande mágico, que tinha sido preso em uma caverna e congelado durante a Grande Guerra. Embora eles sabiam que poderia destruí-los, os magos sábios reunidos todos os seus poderes na tentativa de reanimá-lo. Quando o menino acordou - a sua mente em branco, até mesmo o seu nome esquecido - que havia desaparecido, deixando-o a encontrar o seu destino neste estranho mundo novo. Em CRYSTALIS, você joga o papel do jovem mago, fazendo o seu caminho através da terra hostil de Draygon em um esforço para localizar as armas que você vai precisar para derrotá-lo. Monstros do Draygon e magia negra irá ameaçá-lo em cada turno, mas você não deve vacilar - só você pode levar o mundo a partir de seu flagelo do mal!