Durante um ano, a cidade tem sido tranquila, mas um novo terror robótico tomou conta da cidade! Esse cientista conspirações, Dr. Cossack chegou na cidade com oito novos Metal Maniacs, que são maiores e mais malvado do que qualquer coisa Dr. Wily sonhou. Vai ser um confronto cibernético como as ruas da cidade em erupção com os sons crepitantes de metal derretido! Armado com o novo mega Buster, Mega Man corre, salta e desvia o seu caminho através de labirintos de munchkins metálicos em seu caminho para a cidadela siberiana de Dr. cossaco para o confronto cataclísmico final!